新北京南站占地面積49.92萬平方米，建筑面積31萬平方米。這座龐大建筑地上兩層，地下三層，從上到下依次為:鋼結構屋面層、高架候車層、火車進站出站層、換乘大廳、地鐵4號線、地鐵14號線。根據(jù)北京市的相關交通規(guī)劃，地鐵4號線將以南北走向穿過北京南站，地鐵14號線和市郊鐵路將以東西走向穿過北京南站。北京南站還將成為城際列車和客運專線等快速列車在北京到發(fā)的客運站，成為北京最“快”的客運站。